Za zaščito baterije in preprečevanje prekomernega polnjenja, večina
solarni krmilnik polnjenjavključuje krmilnik polnjenja. Njegova najbolj osnovna funkcija je, da prekine polnilni tok, ko je baterija polna. Zaradi različnih polnilnih lastnosti različnih baterij se
solarni krmilnik polnjenjaje treba izbrati glede na vrsto baterije.